سرویس تطبیق سامانه شاهکار به عنوان یکی از سرویس های اصلی این سامانه که در حال ارائه به نهادها، سازمان ها، بانک ها، کسب و کارها و... می باشد، جهت بررسی تطبیق بین شناسه هویتی ثبت شده برای سرویس با شناسه سرویس مورد بهره برداری قرار می گیرد. این خدمت به عنوان یکی از روش های احراز اصالت هویت مالک سرویس مورد کاربرد خواهد بود. در حال حاضر این خدمت از بستر دولت الکترونیک قابل واگذاری به کسب و کار های مورد تایید این سازمان می باشد.
متقاضیان این خدمت (کسب و کارهای مورد تایید این سازمان) می توانند جهت درخواست، شرح نیازمندی خود را به همراه معرفی نماینده تام الاختیار آن سازمان و یا کسب و کار به صورت مکتوب به اداره کل امنیت سیستم های ارتباطی این سازمان ارسال و پس از بررسی از سوی آن اداره کل در صورت موافقت، دسترسی های لازم به ایشان اعطا خواهد شد.