سرویس تطبیق سامانه شاهکار به عنوان یکی از سرویس های اصلی این سامانه است که در حال حاضر به نهادها، سازمان ها، بانک ها، کسب و کارها و ... ارائه می شود.

این سرویس جهت بررسی تطبیق بین شناسه هویتی ثبت شده برای سرویس با شناسه سرویس مورد بهره برداری قرار می گیرد. این خدمت به عنوان یکی از روش های احراز اصالت هویت مالک سرویس (نظیر تطبیق شماره تلفن همراه و کد ملی شخص حقیقی و یا شناسه ملی شخص حقوقی) مورد کاربرد خواهد بود. در حال حاضر این خدمت از طریق گذرگاه ملی خدمات دولت (GSB) قابل واگذاری به دستگاه های اجرایی و کسب و کار های مورد تایید این سازمان می باشد.